Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms