Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srsf6Q3TWW8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf6Q3TWW8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms