Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf9Q07105 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gdf9Q07105 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms