Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl9P51670 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms