Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kif3aP28741 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kif3aP28741 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms