Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr36E9PV26 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr36E9PV26 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms