Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx6Q9ER75 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx6Q9ER75 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms