Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spns3Q9D232 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spns3Q9D232 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spns3Q9D232 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Spns3Q9D232 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms