Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubqln3Q8C5U9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms