Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkain3Q3URJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms