Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pfdn6Q03958 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pfdn6Q03958 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms