Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cct3P80318 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cct3P80318 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 415 ms