Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa11P50709 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa11P50709 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa11P50709 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa11P50709 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa11P50709 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms