Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox2P48432 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms