Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Epb41P48193 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Epb41P48193 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms