Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capza1P47753 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capza1P47753 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms