Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klc1O88447 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klc1O88447 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms