Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rabep1O35551 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms