Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efna3O08545 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Efna3O08545 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efna3O08545 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms