Protein–RNA interactions for Protein: J3QK25

G530012D18Rik, RIKEN cDNA G530012D1 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G530012D18RikJ3QK25 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
G530012D18RikJ3QK25 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
G530012D18RikJ3QK25 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
G530012D18RikJ3QK25 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
G530012D18RikJ3QK25 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
G530012D18RikJ3QK25 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
G530012D18RikJ3QK25 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms