Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700019A02RikA0A087WPV9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms