Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J1

Tcf7l1, Transcription factor 7-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7l1Q9Z1J1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7l1Q9Z1J1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7l1Q9Z1J1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7l1Q9Z1J1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7l1Q9Z1J1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcf7l1Q9Z1J1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcf7l1Q9Z1J1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf7l1Q9Z1J1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcf7l1Q9Z1J1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcf7l1Q9Z1J1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf7l1Q9Z1J1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms