Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z129

Recql, ATP-dependent DNA helicase Q1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RecqlQ9Z129 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RecqlQ9Z129 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RecqlQ9Z129 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RecqlQ9Z129 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RecqlQ9Z129 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RecqlQ9Z129 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RecqlQ9Z129 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RecqlQ9Z129 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RecqlQ9Z129 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RecqlQ9Z129 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RecqlQ9Z129 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RecqlQ9Z129 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RecqlQ9Z129 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RecqlQ9Z129 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms