Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skp2Q9Z0Z3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skp2Q9Z0Z3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skp2Q9Z0Z3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skp2Q9Z0Z3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skp2Q9Z0Z3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skp2Q9Z0Z3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms