Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arpc1bQ9WV32 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arpc1bQ9WV32 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arpc1bQ9WV32 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arpc1bQ9WV32 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Arpc1bQ9WV32 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Arpc1bQ9WV32 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms