Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkraQ9WTX2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkraQ9WTX2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkraQ9WTX2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkraQ9WTX2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkraQ9WTX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkraQ9WTX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkraQ9WTX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkraQ9WTX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms