Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tk2Q9R088 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tk2Q9R088 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tk2Q9R088 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tk2Q9R088 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tk2Q9R088 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tk2Q9R088 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tk2Q9R088 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tk2Q9R088 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tk2Q9R088 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tk2Q9R088 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tk2Q9R088 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tk2Q9R088 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms