Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh2d3cQ9QZS8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh2d3cQ9QZS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2d3cQ9QZS8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh2d3cQ9QZS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2d3cQ9QZS8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms