Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Copg1Q9QZE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Copg1Q9QZE5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Copg1Q9QZE5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Copg1Q9QZE5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Copg1Q9QZE5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copg1Q9QZE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copg1Q9QZE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Copg1Q9QZE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms