Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnip3Q9QXT8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kcnip3Q9QXT8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kcnip3Q9QXT8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kcnip3Q9QXT8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kcnip3Q9QXT8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Kcnip3Q9QXT8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms