Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SacsQ9JLC8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SacsQ9JLC8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SacsQ9JLC8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SacsQ9JLC8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SacsQ9JLC8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SacsQ9JLC8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms