Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl39Q9JKF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl39Q9JKF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl39Q9JKF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl39Q9JKF7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl39Q9JKF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms