Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3glb1Q9JK48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3glb1Q9JK48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3glb1Q9JK48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3glb1Q9JK48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sh3glb1Q9JK48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3glb1Q9JK48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms