Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna1fQ9JIS7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna1fQ9JIS7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cacna1fQ9JIS7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna1fQ9JIS7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1fQ9JIS7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1fQ9JIS7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacna1fQ9JIS7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacna1fQ9JIS7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cacna1fQ9JIS7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cacna1fQ9JIS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna1fQ9JIS7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cacna1fQ9JIS7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna1fQ9JIS7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cacna1fQ9JIS7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms