Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ercc6l2Q9JIM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ercc6l2Q9JIM3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6l2Q9JIM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ercc6l2Q9JIM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ercc6l2Q9JIM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ercc6l2Q9JIM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ercc6l2Q9JIM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Ercc6l2Q9JIM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ercc6l2Q9JIM3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ercc6l2Q9JIM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ercc6l2Q9JIM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ercc6l2Q9JIM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ercc6l2Q9JIM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ercc6l2Q9JIM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms