Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc22Q9JIG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc22Q9JIG7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc22Q9JIG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc22Q9JIG7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc22Q9JIG7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc22Q9JIG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc22Q9JIG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc22Q9JIG7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc22Q9JIG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc22Q9JIG7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc22Q9JIG7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc22Q9JIG7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc22Q9JIG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc22Q9JIG7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms