Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHU3

Cdk20, Cyclin-dependent kinase 20, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk20Q9JHU3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdk20Q9JHU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk20Q9JHU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk20Q9JHU3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk20Q9JHU3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk20Q9JHU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk20Q9JHU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk20Q9JHU3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk20Q9JHU3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms