Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htr3bQ9JHJ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Htr3bQ9JHJ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Htr3bQ9JHJ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Htr3bQ9JHJ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Htr3bQ9JHJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Htr3bQ9JHJ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Htr3bQ9JHJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms