Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc13a1Q9JHI4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc13a1Q9JHI4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc13a1Q9JHI4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc13a1Q9JHI4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc13a1Q9JHI4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc13a1Q9JHI4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc13a1Q9JHI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms