Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tssc4Q9JHE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tssc4Q9JHE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tssc4Q9JHE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tssc4Q9JHE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tssc4Q9JHE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tssc4Q9JHE7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tssc4Q9JHE7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tssc4Q9JHE7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tssc4Q9JHE7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms