Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ropn1Q9ESG2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ropn1Q9ESG2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ropn1Q9ESG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ropn1Q9ESG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ropn1Q9ESG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ropn1Q9ESG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ropn1Q9ESG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ropn1Q9ESG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms