Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Clstn2Q9ER65 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Clstn2Q9ER65 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Clstn2Q9ER65 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Clstn2Q9ER65 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Clstn2Q9ER65 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Clstn2Q9ER65 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Clstn2Q9ER65 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Clstn2Q9ER65 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Clstn2Q9ER65 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Clstn2Q9ER65 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Clstn2Q9ER65 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Clstn2Q9ER65 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Clstn2Q9ER65 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Clstn2Q9ER65 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Clstn2Q9ER65 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Clstn2Q9ER65 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Clstn2Q9ER65 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Clstn2Q9ER65 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Clstn2Q9ER65 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Clstn2Q9ER65 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Clstn2Q9ER65 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Clstn2Q9ER65 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Clstn2Q9ER65 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Clstn2Q9ER65 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Clstn2Q9ER65 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Clstn2Q9ER65 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clstn2Q9ER65 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clstn2Q9ER65 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Clstn2Q9ER65 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms