Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r29Q9EQ41 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r29Q9EQ41 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r29Q9EQ41 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r29Q9EQ41 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r29Q9EQ41 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r29Q9EQ41 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r29Q9EQ41 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r29Q9EQ41 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r29Q9EQ41 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r29Q9EQ41 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r29Q9EQ41 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r29Q9EQ41 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r29Q9EQ41 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r29Q9EQ41 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r29Q9EQ41 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r29Q9EQ41 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r29Q9EQ41 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms