Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms