Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rp2Q9EPK2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rp2Q9EPK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rp2Q9EPK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rp2Q9EPK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rp2Q9EPK2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp2Q9EPK2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp2Q9EPK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms