Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3fQ9DCH4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eif3fQ9DCH4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3fQ9DCH4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3fQ9DCH4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3fQ9DCH4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3fQ9DCH4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3fQ9DCH4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms