Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CrotQ9DC50 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CrotQ9DC50 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CrotQ9DC50 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrotQ9DC50 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrotQ9DC50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CrotQ9DC50 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CrotQ9DC50 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrotQ9DC50 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrotQ9DC50 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CrotQ9DC50 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CrotQ9DC50 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CrotQ9DC50 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CrotQ9DC50 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms