Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc54Q9DAL3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc54Q9DAL3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc54Q9DAL3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc54Q9DAL3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc54Q9DAL3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc54Q9DAL3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms