Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mrpl17Q9D8P4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mrpl17Q9D8P4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Mrpl17Q9D8P4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl17Q9D8P4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mrpl17Q9D8P4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl17Q9D8P4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mrpl17Q9D8P4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms