Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AplfQ9D842 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AplfQ9D842 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AplfQ9D842 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AplfQ9D842 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AplfQ9D842 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AplfQ9D842 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AplfQ9D842 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms